舰船作为核心战略单位，其功能划分直接影响玩家的战术布局和资源分配策略。舰船主要分为战斗舰、工程舰和特殊功能舰三大类，每类舰船在星际探索和战斗中承担着不可替代的职责。战斗舰包含护卫舰、驱逐舰、巡洋舰、战列巡洋舰和航空母舰等，这些舰船通过火力输出、防御支援等不同定位构成舰队的主体战力。工程舰则专注于资源采集和基地建设，是维持势力发展的后勤保障。特殊功能舰包括侦察舰、维修舰等，为舰队提供战术辅助能力。
战斗舰的功能差异主要体现在火力类型、防御属性和战术定位上。护卫舰作为小型舰船，指挥值需求低且生产成本低廉，在游戏前期承担主力输出职责，后期转型为防空、反导等功能性角色。驱逐舰在火力强度和护甲穿透能力上优于护卫舰，部分型号还具备战场维修功能。巡洋舰作为大型舰船，拥有显著提升的血量和护甲值，是中期舰队的中坚力量。战列巡洋舰在生存能力上进一步强化，但需要更高的指挥值投入。航空母舰以其超高的防御属性和载机能力，成为后期攻坚战的战略武器。
工程舰的功能集中体现在资源采集效率与仓储容量两个维度。小型工程舰适合初期资源点开发，中型和大型工程舰则能显著提升采集速度。工程舰需要搭配仓库舰使用，通过增加存储容量减少往返基地的频率，这是提升采集效率的关键。资源采集量由计划采集和基地产量共同决定，玩家需要通过升级金属炼化工厂、水晶合成工厂等建筑来优化产出。工程舰编组时携带多功能舰船可提升队伍容量，但需注意边际效益递减规律。
特殊功能舰在战术执行层面具有独特价值。侦察舰凭借高速移动和广域探测能力，为舰队提供战场情报和曲率航行坐标。维修舰虽然在中后期治疗量相对不足，但在对抗低级野怪和城防舰队时仍能发挥续航作用。导弹舰和鱼雷舰等专精型舰船，可针对特定目标实施精确打击。防空型舰船需要根据敌方航空兵力配置灵活编入舰队，这类舰船对护航艇和战机具有克制效果。
舰船功能强化的途径包括技术值分配和蓝图研究。技术值可通过战斗、任务或开箱获取，用于提升特定舰船的子系统和武器性能。蓝图系统允许玩家解锁新型号舰船或强化现有舰船，研究过程中可能出现子型号或技术储备。主力舰蓝图和超主力舰蓝图具有更高战略价值，但获取难度相应增加。玩家需要平衡研发成本、维护费用和实战需求，建立符合自身发展阶段的舰船配置方案。
舰船功能的充分发挥依赖于合理的编队策略和指挥系统。计划圈机制限定了舰队的行动范围，跨计划圈行动将消耗更多策略值。曲率航行和中转航行需要依托己方建筑或舰队提供的坐标支持。指挥值系统限制了单支舰队的规模，玩家需要根据基地等级提升逐步扩展舰队容量。在编组舰队时，需综合考虑前排防御、中排输出和后排支援的功能搭配，同时注意不同舰船对资源类型的消耗差异。
